學科是大學的基本單元，是大學履行人才培養、科學研究、社會服務、文化傳承創新、國際交流合作等各項職能的核心載體，學科建設是高校高質量發展的重要支撐,也是新時代建設高質量高等教育體系、培養高素質人才的關鍵所在。山東中醫藥大學聚焦新醫科和高等醫學教育要求，服務國家重大戰略和我省經濟社會高質量發展，遵循“大中醫”思維，加快推進“一核兩翼四交叉”學科建設規劃，以一流中醫藥學科建設帶動一流中醫藥大學建設。
強化頂層設計和戰略謀劃，發揮學科建設龍頭地位新優勢。
堅持“統籌建設資源、服從國家需求、加強部門協同、強化績效考核、實施動態調整”原則，不斷完善學科建設管理體制機制，構建了“學校-學院-學科”三級管理體系，出臺了《學科建設與管理辦法》《學科帶頭人遴選與管理辦法》《學科績效考核管理辦法》等系列規章制度，支持和強化學院的學科建設主體地位，管理重心下移，下放相關的人權、財權、物權，增強學院的建設活力。學校、各職能部門、學科建設學院橫向協同、縱向聯動，形成順暢的日常工作協調機制，保障學科建設高質量發展。學校在省屬高校中擁有國家重點學科最多，首批獲得碩士、博士學位授權，首批設立博士后科研流動站，首批成為國家“973”項目首席承擔單位，碩士點數量位居全國同類院校前列。當前，學校擁有國家級重點學科3個、省級重點學科11個、國家中醫藥管理局重點學科37個、省中醫藥重點學科34個，有博士一級學科3個、碩士一級學科9個。
優化學科布局和生態體系，完善“一核兩翼四交叉”學科建設新格局。
緊緊抓住國家“雙一流”和我省“雙高”建設重大契機，強化頂層設計、調整學科布局、健全學科評價體系、提升學科建設綜合集約效能。聚力打造以中醫學科為核心，以中藥、中西醫結合為兩翼，深度推進醫文、醫理、醫工、醫藥交叉融合發展。以體制機制改革為動力，以人才培養質量提升為根本，以人才隊伍建設為抓手，以科研創新為引擎，以服務經濟社會為導向，以提升中醫藥防治重大疾病水平為突破口，全面提升中醫學綜合實力和核心競爭力，形成了多學科相互支撐、協調發展、重點突出、梯次分明的“雁陣式”學科發展體系。中醫學先后獲批山東省一流學科、高峰計劃學科、高峰學科，在2022年度GDI一流學科排名中位列全國第3；中藥學先后獲批山東省一流學科、優勢特色學科，中西醫結合獲批山東省優勢特色學科，生物醫學工程獲批山東省培育學科；臨床醫學、毒理學與藥理學兩個學科進入ESI全球前1%。
搭建學科交叉平臺和融合機制，注入學科創新發展新動能。
學校充分發揮協同創新優勢，理順交叉學科體制機制，以學科交叉與融合建設為著力點，打破學科專業壁壘，組建跨學科團隊，搭建多元化學科交叉共享平臺。依托中醫藥主干學科優勢，大力開展“中醫藥+”及“+中醫藥”的交叉研究，推動中醫藥學科與海洋科學、新材料、免疫學、人工智能等學科的交叉融合。近年來，學校獲批3個交叉學科學位點，中醫外治學、海洋中藥學2個交叉學科獲批國家中醫藥管理局高水平中醫藥重點學科，海洋中藥學、系統中醫學、中醫藥人工智能學3個交叉學科獲批山東省中醫藥重點學科?！爸嗅t藥+”學科交叉融合在服務國家和省市重大戰略中的顯示度、貢獻度、首位度不斷彰顯。
改革創新團隊和管理機制，激發科研人員創新創造新活力。
堅持創新科研管理，推進首席專家負責制，完善以創新能力、質量、實效、貢獻為導向的人才評價體系，出臺了《科研創新團隊建設管理辦法》，創建了19支科研創新團隊、42支青年創新團隊，形成了“首席帶動團隊、團隊促進方向、方向推動學科”的協同發展模式。圍繞健康中國、黃河流域生態保護和高質量發展等國家戰略需求和中醫藥重大科學問題，堅持“四個面向”，促進“四鏈融合”，加快培育中醫藥領域國家戰略科技力量。近兩年，學校獲批國家重點研發計劃1項、子課題5項，國家自然科學基金69項，國家社科基金1項，省優秀青年基金1項；獲山東省科技進步獎13項、第三屆全國創新爭先獎1項。
