培訓時間:2017年12月7-8日(周四至周五)
培訓地點:蘇州創騰科技培訓中心(江蘇省蘇州市工業園區東長路88號2.5產業園A2棟301室)
?培訓主旨:
抗體藥物作為生物藥物的主力軍,以其高特異性、有效性和安全性正在發展成為國際藥品市場上一大類新型診斷和治療藥物,日益成為許多重要疾病(癌癥、慢性炎癥疾病、心血管疾病、免疫系統疾病等)治療市場的新寵。而分子模擬技術在近20年內已兩次榮登諾貝爾化學獎的獎臺,成為生命科學領域認識和解決復雜的科學和工程問題的重要方法。借助分子模擬技術進行抗體藥的理性設計已成為未來治療性抗體研發新趨勢,其重要作用也越來越多的得到體現。Discovery Studio作為面向生命科學領域的分子模擬與分子設計軟件,不僅可以為抗體研發者們提供一個易于操作使用的抗體建模環境,而且還可以以抗體結構作為起點,優化抗體作為治療性藥物的療效和藥物可發展性,從而助力抗體新藥研發,提高抗體成藥性,加速抗體研發周期,降低研發成本。本次培訓班旨在幫助學員系統了解、掌握如何應用Discovery Studio進行抗體理性設計并快速上機操作。
?培訓對象:
從事抗體藥物研發相關領域的科研工作者,以及有興趣想要借助Discovery Studio分子模擬平臺來開展抗體理性設計工作并能快速上機模擬操作的相關人員。
?培訓內容:
本次培訓主要以Discovery Studio軟件為依托,詳細介紹DS在抗體理性設計領域提供的一系列完美解決方案與上機操作,內容包括:
- 抗體序列的注釋:抗體重鏈及輕鏈可變區、恒定區、CDR區的注釋,抗體Gemline基因的識別;
- 抗體序列的分析:抗體翻譯后修飾位點的預測(如糖基化位點等),抗原線性表位預測;
- 抗體結構的預測與優化,全長抗體、抗體Fab區、scFv結構的預測,抗體人源化改造;
- 抗體-抗原相互作用的預測,抗原構象表位的識別;
- 抗體分子的設計與改造:抗體親和力成熟,抗體穩定性優化,雙特異性抗體設計,抗體聚集效應分析。
?培訓形式:
1、通過文獻案例分析講解抗體理性設計策略,以及相應功能模塊的原理介紹;
2、上機操作:講解抗體理性設計過程中每一步驟的具體操作流程及參數設置(提供完整的培訓教程);
3、學員交流與討論,工程師進行現場答疑答疑。
?課程安排:
第一天
08:30-09:00
報到和注冊
報到地點:蘇州創騰培訓中心
09:00-10:30
Discovery Studio基本界面
DS背景介紹,DS界面介紹,DS入門操作,
抗體、抗原分子的預處理方法介紹與實際操作。
10:30-10:45
茶歇
10:45-11:45
抗體理性設計概述
抗體理性設計專題之一:抗體序列的分析
基于抗體序列注釋抗體結構域和CDR loop區,識別Gemline基因,預測PTM翻譯后修飾位點、抗原線性表位。
11:45-13:30
午餐
13:30-15:00
抗體理性設計專題之二:抗體結構的預測及優化、抗體人源化
抗體Fab區、Fv區、scFv、全長結構及雙特異性抗體結構的構建,CDR區的優化,抗體人源化改造策略,基本原理介紹及案例分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗體理性設計專題之二:抗體結構的構建及優化、抗體人源化
抗體建模參數設置、實際操作技巧及結果分析。
16:30-17:15
課程討論及答疑
第二天
09:00-10:15
抗體理性設計專題之三:抗體-抗原相互作用預測(CDOCKER)
抗體、抗原結合模式的確定,結合表面關鍵殘基的分析,抗原表位的識別。
基本原理介紹及案例分析、參數設置、實際操作技巧及結果分析。
10:15-10:30
茶歇
10:30-11:45
抗體理性設計專題之三:抗體-抗原相互作用預測(ZDOCK)
抗體、抗原結合模式的確定,結合表面關鍵殘基的分析,抗原表位的識別。
基本原理介紹及案例分析、參數設置、實際操作技巧及結果分析。
11:45-13:30
午餐
13:30-14:15
抗體理性設計專題之四:抗體親和力成熟(虛擬氨基酸突變掃描)
虛擬氨基酸掃描突變,識別能夠優化抗體結合親和力的突變位點,pH和溫度等環境因素的考慮。
基本原理介紹、案例分析、參數設置、實際操作技巧及結果分析。
14:15-15:00
抗體理性設計專題之五:抗體穩定性優化(虛擬氨基酸突變掃描)
虛擬氨基酸掃描突變,搜索能夠穩定抗體結構的突變位點,抗體人源化過程中影響穩定性的back mutation位點的分析。
基本原理介紹、案例分析、參數設置、實際操作技巧及結果分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗體理性設計專題之六:抗體穩定性優化(抗體聚集效應的預測)
識別抗體結構中易于聚集的位點以進行突變優化,以抗體聚集效應作為指標評價抗體的穩定性和可發展性以篩選在研抗體。
基本原理介紹、案例分析、參數設置、實際操作技巧及結果分析。
16:30-17:15
課程討論及答疑