南通大學牢牢抓住全面提高人才培養質量這個核心點，不斷深化教育教學綜合改革，促進產業鏈、創新鏈、人才鏈的深度融合，逐步構建創新型人才培養體系。
結合社會發展，優化人才培養體系。學校面向新興產業和區域發展的需求調整人才培養結構和質量，組織開展本科專業結構優化調整工作，在打造好重點專業、特色專業的同時，學校還建立跨學院和學科的專業合作機制，整合優質資源，組建成立張謇學院，采用個性化培養方案，開展新工科、產教融合人才培養模式變革。學校先后與地方政府、企業合作共建通科微電子學院等，完善產學協同育人機制，構建“政產學研”一體的創新型人才培養體系。
以學生為中心，創新人才培養機制。學校以促進學生全面發展為根本標準，完善本科人才培養方案，明確各類課程和教學環節與學生知識、能力、素質達成的關聯性，圍繞“通識、基礎、專業”課程群增設多元課程，推動課程內容重組，靈活設置課程模塊，鼓勵學生開展豐富多樣的課外自主學習；引領教師開展翻轉課堂等線上線下相結合的課程教學改革，以任務驅動調動學生學習的積極性和主動性；改革考試考核內容和方法，全面推進學生學業形成性評價，探索靈活多樣的開放考核方式，強化學生的創新能力和實踐能力培養。
豐沃創新土壤，構建創新訓練平臺。學校成立創新創業教育學院，建立“國家、省、校、院”四級大學生創新創業訓練計劃項目體系，打造“四層三維”學科競賽平臺，多部門協同，廣泛開展大學生創新創業訓練。構建與知名醫院、學校、科研院所和企業的戰略聯盟，培育了一批科技創業實習基地，為學生提供實踐實習平臺。學校將鼓勵開展學科競賽作為系統性改革的重點領域，進行一系列制度創新。以賽促學、以賽促教，不斷提升創新型人才培養成效。
