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          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          教育裝備采購網 2022-11-03 11:52 圍觀360次

            DDR1 主要包括 DDR1a、DDR1b、DDR1c、DDR1d 和 DDR1e 五個亞型,亞型的不同主要是由跨膜激酶蛋白的 mRNA 選擇性剪接所導致,而 DDR2 至今尚未發現其它亞型。DDRs 在人和小鼠組織中表達廣泛,涉及細胞形態的形成、分化、增值、黏附、遷移和侵襲。大量的研究表明,DDR1 和 DDR2 是多種炎性細胞因子分泌的關鍵介質[1-3],在多種炎癥性疾病中失調,如動脈粥樣硬化、骨關節炎、器官纖維化。膠原誘導的 DDR1b 的靈活可以顯著促進巨噬細胞在炎癥反應過程中產生白細胞介素 8( IL-8 )、巨噬細胞炎性蛋白 1α (MIP-1α) 和單核細胞趨化蛋白 1 (MCP-1)。DDR1 敲除的小鼠可以降低脂多糖(LPS)誘導的趨化因子分泌,并使死亡率降低。小分子 DDR1 抑制劑可以減少炎性細胞因子的釋放,在小鼠炎癥模型中明顯的治療效果。

            研究表明,DDR2 的靈活可促進人樹突狀細胞產生 IL-12、腫瘤壞死因子α(TNF-α)、干擾素γ(INF-γ) 等細胞因子,對炎癥性疾病有重要作用。Ⅰ型膠原介導的 DDR2 靈活對于纖維化發生至關重要,在早期酒精性肝病模型中,沉默 DDR2 的表達可減少酒精性肝損傷和纖維化。I 型膠原靈活 DDR2 可以誘導原代人肺成纖維細胞中 DDR1 的表達,表明這兩種受體之間可能存在串擾[4-5]。因此,DDR1 和DDR2 雙靶點抑制劑的開發可能是抗炎藥物研發頗有希望的策略。目前已報道了大量的 DDR1 和 DDR2 抑制劑,但大部分化合物選擇性差,因此急需尋找選擇性好的 DDR1 和 DDDR2 雙靶點抑制劑。

            基于這一出發點,作者對課題組前期報道的 DDR1 選擇性抑制劑 4(DDR1, IC50:9.7 nM; DDR2,  IC50:175 nM)進行結構改造。(圖1)首先,分析化合物 4 與 DDR1 蛋白、DDR2 蛋白的結合模式(圖2A-2B),化合物以相似的激酶二型結合模式作用于 DDR1 和DDR2。有意思的是,化合物可以與 DDR1 的 Met704、Glu672、Asp784 殘基形成四個氫鍵,而不能與 DDR2 蛋白中相應的 Met95 形成氫鍵。此外,DDR2蛋白中的空間位阻使得化合物 4 中的吡唑啉[1,5-a]嘧啶基團與 Tyr94、Met95 殘基發生碰撞,進而導致其對 DDR2 的活性較弱。作者通過骨架遷躍的策略,對該基團進行替換,設計了一系列化合物,獲得化合物 5n不僅具有雙重 DDR1 和 DDR2 抑制活性,同時對 Abl1 具有較好的選擇性(DDR1,  IC50:9.4 nM; DDR2, IC50:20.4 nM;Abl1, IC50:494 nM),其與 DDR1 蛋白的晶體結構復合物揭示了其確切的作用模式(圖3)

          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          圖1.化合物 4 的結構式及化合物的設計(圖片來源:《J. Med. Chem.》)

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          圖2 化合物 4 與 DDR1、DDR2的結合模式預測(圖片來源:《J. Med. Chem.》)

          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          圖3.化合物 5n 的結構式及其與 DDR1 的共晶結合模式圖(圖片來源:《J. Med. Chem.》)

            采用 DiscoveRx 方法測得化合物 5n與 DDR1、DDR2 蛋白的結合常數分別為 7.9 nM 和 8.0 nM。激酶譜實驗評價了化合物 5n 對 468 種激酶的影響,化合物的總體選擇性較好,但對 Abl1,EPHA2, EPHA7,EPHA8,EPHB2,LCK,LOK,TIE2,TrkA,TrkB 和 TrkC 等靶點的選擇性較差,結果如圖 4 所示。

          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          圖4. 化合物 5n對脫靶激酶的活性(圖片來源:《J. Med. Chem.》)

            采用原代人肺成纖維細胞評價化合物對 DDR1 和 DDR2 蛋白活化的影響,Western 結果如圖5所示,化合物可以劑量依賴性的降低 DDR1 和 DDR2 的磷酸化,且對總蛋白的量不產生影響。此外,化合物在 50 nM 和 100 nM 對 c-Abl 激酶的磷酸化均不產生影響。

          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          圖5.化合物 5n 對 DDR1 和 DDR2 磷酸化的影響

          (圖片來源:《J. Med. Chem.》)

            由于 DDR1 和 DDR2 是多種炎性細胞因子分泌的關鍵介質,因此作者分別評價了化合物 5n 在體外和體內的炎癥改善效果。首先,化合物 5n 可以降低原發性腹腔巨噬細胞種 LPS 誘導的 IL-6 分泌(圖6)。其次,化合物可以改善 LPS 誘導的急性肺損傷小鼠模型中的炎癥癥狀。(圖7)

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          圖6.化合物 5n可以降低原發性腹腔巨噬細胞種 LPS 誘導的 IL-6 分泌

          (圖片來源:《J. Med. Chem.》)

          DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑的設計合成及其抗炎作用研究 | MedChemExpress

          圖7. 化合物 5n可以改善LPS誘導的急性肺損傷小鼠模型中的炎癥癥狀

          (圖片來源:《J. Med. Chem.》)

            小M 的小思考:

            近年來,人們對 DDRs 蛋白的作用機制及臨床意義進行了深入的研究,證明其參與體內多種信號通路的傳導和多種生理病理過程。由于其在炎癥方面的重要作用,使得其成為開發抗炎藥物的重要靶點。本文作者通過分析選擇性DDR1 抑制劑在生物學上存在的不足,致力于開發 DDR1 和 DDR2 雙靶點抑制劑,并獲得了化合物 5n,其在體內外均具有較強的抗炎活性。這一研究為尋找有效抗炎活性的候選藥物提供了新的思路。

            參考文獻

            [1] Leitinger, B. Discoidin domain receptor functions inphysiologicaland pathological conditions. Int. Rev. Cell Mol. Biol. 2014, 310, 39−87.

            [2] Borza, C. M.; Pozzi, A. Discoidin domain receptors in disease. Matrix Biol. 2014, 34, 185.192.

            [3] Li, Y.; Lu, X.; Ren, X.; Ding, K. Small molecule discoidindomain receptorkinase inhibitors and potential medical applications. J. Med.Chem. 2015, 58, 3287−3301.

            [4] Yang, J.; Wheeler, S. E.; Velikoff, M.; Kleaveland, K. R.; Lafemina,M. J.; Frank, J. A.; Chapman, H. A.; Christensen, P. J.; Kim, K. K. Activatedalveolar epithelial cells initiate fibrosis through secretion of mesenchymalproteins. Am. J. Pathol. 2013, 183, 1559−1570

            [5] Luo, Z.; Liu, H.; Sun, X.; Guo, R.; Cui, R.; Ma, X.; Yan, M. RNAinterference against discoidin domain receptor 2 ameliorates alcoholic liverdisease in rats. PLoS One 2013, 8, No. e55860.

            [6] Wang, Z.;Ding, K.;Lu, X et al.Design, Synthesis, and Biological Evaluation of 3 -(Imidazo[1,2.a]pyrazin-3-ylethynyl)-4-isopropyl.N.(3-((4-methylpiperazin-1-yl)methyl)-5(trifluoromethyl)phenyl)benzamide as a Dual Inhibitor of Discoidin DomainReceptors 1 and 2. J. Med.Chem.

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