學校施行學分制管理起步較早，自2000年開始，以洛陽工學院部分本科專業進行學分制試點改革；2005年至2011年除醫學類專業全部施行學分制，期間制定、修訂了一系列學分制相關文件，學分制管理機制培養體系基本形成；2012年全部專業實施學分制，2014年學校出臺了《學分制學費管理暫行辦法》，成為省內首家按學分收費的高校，學分制改革得到全面深化提高。
為配套學分制，河南科技大學進行了多方面改革。
建立多元化課程體系，不斷修訂培養方案，降低必修課學分，大幅增加選修課數量，施行按專業大類招生、按專業分流、按能力模塊培養的“三階段”培養框架，構建了“通識教育、基礎教育、專業教育及實踐教育”四平臺課程體系。在2020年疫情防控的大環境下，網上教學成為學習主要途徑，學校通過搭建網絡教學平臺、數字化教學資源中心、在線開放課程平臺和學習移動端APP，共開設各類課程1680門，擁有教學資源3.2萬個。
改革學籍管理，采用學分衡量學生學習的量，用平均學分績點評定學生學習的質，實行彈性學制，學生可在3至8年內完成學業。學生選課自由，可以跨年級、跨專業、跨學科自主選擇課程、任課教師和學習進度。學校鼓勵確有興趣專長的學生選擇自己適合的專業，尊重學生的興趣愛好，在創新創業實踐中取得顯著成效的學生可優先轉入相關專業學習，鼓勵、支持和指導學生參加社會實踐、創新創業活動，將學生參加創業培訓，開展創新實驗、發表論文、獲得專利和自主創業等情況記錄于課外培養（第二課堂）成績單，并予以學分認定，也可在評先評優、免試保研時加分。對于學有余力的學生，可以申請輔修雙學位，促進復合型人才的培養，體現“以生為本”的教育理念，滿足了廣大學生自主發展、多樣化成才的需要。
實施學業導師制，每年選聘600多名高層次教師充實學業導師隊伍。學業導師由專業導師和年級導師組成，已經形成學業導師“團隊化”建設體系。同時聘請企業家、創業成功者、杰出校友作為創新創業就業導師，形成了學業導師“團隊化”建設體系，為學生在學業規劃、能力培養和知識傳授等方面提供指導服務。
改革課堂教學模式，改變以往知識灌輸式的教學方式，注重知識、能力、素質的綜合培養，廣泛開展啟發式、討論式、參與式教學。任課教師采用“互聯網+教育”先進理念，積極探索線上線下混合式教學等新的教學模式，促進了學生個性化發展。
增強平臺建設和后勤保障，學校先后投資300多萬元引進數字化校園管理平臺，2020年再次投入200萬升級教學管理軟硬件。引入更加適應學分制教學的教學管理系統，實現了近4萬學生自由網上選課和學籍、學業的電子化規范管理。
河南省教育廳下發《河南省教育廳關于公布河南省學分制管理示范高校建設名單的通知》，經過在全省學分制管理高校中遴選，河南科技大學通過申報、答辯、評審，順利進入首批學分制管理示范高校。
