實驗室中要張貼如何處理溢出物的實驗室操作規則，每一位使用實驗室的成員都要閱讀并理解這些規程。一旦在生物安全柜中發生有生物學危害的物品溢出時，應在安全柜處于工作狀態下立即進行清理。要使用有效的消毒劑，并在處理過程中盡可能減少氣溶膠的生成。所有接觸溢出物品的材料都要進行消毒和／或高壓滅菌。
生物安全柜生物危害溢出和清理步驟：生物安全柜生物危害溢出和清理，等待至少5分鐘，讓安全柜充滿氣溶膠，在清理時穿戴實驗服，安全眼鏡和手套，清理時讓安全柜繼續工作，進行消毒處理并保證至少20分鐘的接觸時間，使用浸泡消毒劑的消毒紙巾吸附溢出物，使用浸泡消毒劑的消毒紙巾擦拭安全柜內壁，工作臺表面和柜內所有設備，按照正確的生物廢棄物處理步驟處理被污染的物質（比如高壓滅菌器或 BFI） ，將可回收的被污染物品放入生物危害物回收袋或高壓滅菌盤并且用報紙包起來，然后進行消毒或清理，用消毒劑對無法進行高壓滅菌的物品進行至少20分鐘的消毒處理后再拿出 安全柜，脫下個人防護服并放進污染物收集袋中進行高壓滅菌處理，在進行新的實驗或者關閉安全柜之前，讓安全柜運行10分鐘。
