基于 SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization ) 技術，在磁珠法反應體系中，核酸分子（DNA & RNA）會由線性壓縮成球狀， DNA 在一定濃度的 PEG 存在條件下，NaCl 或 MgCl2 促進條件下，DNA 分子構象會發生急劇變化，會暴露出磷酸骨架上大量的帶負電荷的磷酸基團，與表面帶負電荷的羧基-COOH 磁珠結合。目前認為這種負負電荷間的作用是由于帶正電荷的鹽離子的作用（如 Na+）。帶負電磷酸基團借由解離的鹽離子（如 Na+）與羧基形成「陰離子-陽離子-陰離子」的鹽橋結構，使 DNA 被特異性吸附到羧基磁珠表面。而當反應緩沖液被棄除后，加入水性分子，會快速充分水化核酸分子，解除三者之間的離子相互作用，使吸附到磁珠上的核酸分子被純化出來。利用磁珠的磁性，可通過外加磁場進行收集。
受益于高通量測序技術的發展，磁珠也憑借其高通量，適用于自動化的特點備受推崇，廣泛用于 NGS 文庫構建中的 DNA 提取純化及雙輪分選（片篩）。
DNA 提取純化的目的在于去除不想要的片段、回收需要的片段。由于磁珠優先吸附大片段，因而可通過一定比例的磁珠吸附特定大小以上的片段，丟棄上清（去除非目標片段）后將磁珠吸附的 DNA 洗脫回收。
DNA 雙輪分選（片篩）目的在于從片段中選擇特定區域的 DNA 片段大小。由于磁珠優先吸附大片段，因而需通過兩輪磁珠操作進行分選。
兔牙生物科技研發的 BunnyMagTM 磁珠分選純化試劑盒中的磁珠，與市面上大部分的磁珠類似，
磁珠結構（分為 3 層）：
? 內層的核心是 Polystyrene，PS
? 第二層包裹磁性物質——四氧化三鐵（Fe3O4）
? 外層表面是羧基（-COOH）修飾的高分子材料
磁珠體系主要包括磁珠、聚乙二醇（PEG）、鹽離子（NaCl）
兔牙科技 BunnyMagTM 磁珠的優勢：
?。?）樣本需求量低：微量的材料即可提到高濃度的核酸；
?。?）操作簡單快速：整個操作流程基本分為五步（裂解、結合、洗滌、干燥、洗脫），全程無需離心操作，大多可在 30～60 分鐘內完成；
?。?）質量穩定可靠：游離的磁珠與核酸的結合量更大，特異性的結合使得核酸純度更高，且可通過控制磁珠表面基團來調節核酸回收量；
?。?）全自動化操作：采用核酸提取儀可實現自動化、高通量操作，可實現幾十甚至幾百個樣品的提??；
?。?）安全無毒無害：試劑不含酚等有毒化學試劑，完全符合現代化環保理念。
