1.RNA在細胞內極易降解，樣本選擇時一定要選取新鮮的樣本組織或者取樣后迅速低溫處理（液氮速凍）；樣本出現多次反復凍融后，RNA得率會嚴重下降，也會導致RNA降解；RNA提取環境要保持無RNA酶污染；
2.RNA容易受到環境污染導致RNA嚴重降解，建議實驗過程中注意更換實驗手套，使用所有耗材應該均無RNA酶的一次性耗材；
3.試劑盒中BufferEB（RNA專用）中含有少量EDTA，可能影響下游實驗，使用時適當稀釋，如果用其他洗脫液洗脫，要確保PH>7.5，PH過低影響洗脫效率；
4.離心柱漂洗完成后，盡可能烘干柱膜上殘留乙醇，殘留乙醇會影響洗脫效率和下游實驗效果；柱膜也不建議過度干燥，沒有乙醇味道殘留最好，如果過度干燥可能影響RNA溶解；如果A260/230值過低，說明樣本提取過程中漂洗不徹底，有鹽離子殘留，建議增加漂洗次數；
5.對于RNA提取，A260/280<1.9說明有可能存在DNA污染或者蛋白污染，如果洗脫樣本時沒有使用BufferEB，而使用ddH20（確保無RNA酶），比值或偏低，因為Ph值會影響吸光值，并不表示樣本純度低；
6.如果提取的樣本RNA發生嚴重降解，可能是由于裂解液沒能完全滅活樣本中RNA酶，建議增加裂解液使用量（具體參見說明書）或者降低樣本初始量；
7.RNA完整性可以通過超微量核酸檢測儀檢測或者瓊脂糖凝膠電泳（電泳條件：膠濃度1%；1XTAE電泳緩沖液）來判斷；一般樣本RNA電泳條帶為兩條帶，對于植物樣本，有可能存在葉綠體RNA干擾，條帶數量大于4條，并不表示RNA提取發生降解；
8.電泳環境受到RNA酶污染，也會造成RNA降解，電泳檢測不準確，確保電泳過程中電泳緩沖液，上樣緩沖液無RNA酶污染；
9.RNA提取一般是傳統TRIzol方法和改進的柱式方法；對于TRIzol法進本可以提取大部分樣本RNA，但是對于多糖多酚植物樣本，建議使用者盡量選擇具有針對性的試劑盒（參見目錄），傳統TRIzol法無法有效去除多糖多酚這些次生代謝物；
10.對于植物樣本，樣本處理量無法統一確定，對于一般樣本（煙草，擬南芥等），提取量不超過100mg鮮重組織或者20mg干重組織，對于復雜樣本（水稻，玉米，榆樹等），建議初始樣本量不超過50mg鮮重或者10mg干重組織；如果需要較高的RNA量，可以采取多管濃縮的方法提取RNA;
11.對于植物樣本，如果離心時堵塞離心柱，建議減少初始樣本量；
12.對于血液樣本，如果樣本中含有血塊，說明樣本收集時未加入血液抗凝劑；建議重新收集樣本并加入EDTA，肝素，檸檬酸等抗凝劑；
13.RNA濃度及純度判斷：[RNA]μg/ml=A260 x稀釋倍數x40.0 （40.0：RNA的平均吸收系數）；
14.參考電泳圖：（電泳圖來源：使用者使用本公司SN0306AD提取梨果肉RNA電泳圖）
