基因合成是指在體外人工合成雙鏈DNA分子的技術，與寡核苷酸合成有所不同:寡核苷酸是單鏈的，所能合成的最長片段僅為100nt左右，而基因合成則為雙鏈DNA分子合成，所能合成的長度范圍50bp-12 kb?；蚝铣墒怯萌斯し椒ê铣苫虻募夹g，是基因獲取的手段之一，相對于從已有生物中獲取基因來說，基因合成無需模板，因而不受基因來源限制。
人類首條人工合成的基因出現在上世紀60年代，基因合成是當前合成生物學的主要內容，通過基因合成，可以獲得自然界中不存在的基因，為人類改造生物開辟了一個全新的方向，在可預計的將來，基因合成將在生命科學領域發揮巨大作用，在新能源、新材料、人工生命、核酸疫苗、生物醫藥等領域的作用已初步體現?；蚝铣梢泊嬖跐撛诘谋婚_發成生物武器的可能，而這個可能性在幾個病毒的人工合成之后變得更加突出。
基因合成有兩種途徑，一是向基因合成公司訂制，二是作本地基因合成。由于基因合成技術還沒有一個統一的方法，基因合成的技能和經驗在合成過程中具有決定性的影響，所以大部分基因合成都是在專業人員手中完成的，這也決定了途徑一是主要渠道。
本地基因合成一般需要參考學術文章，這方面的文章有很多。但大多只是個別基因的合成，只具備有限的參考價值，除非是那些為了研究技術本身而作的基因合成。對于需要作本地基因合成的實驗者來說，使用"基因合成試劑盒"也許是一個好的選擇。
基因合成的優點：一:合成周期短，可以保證序列的100%正確無誤；二:基因合成具有更大的靈活性，可以對基因的酶切位點和基因序列進行修改，方便下游的克隆和實驗；三:研究人員根據自己的意愿設計得到自然界中很難獲得甚至不存在的基因；四:基因合成的基因可以進行密碼子優化，使基因在各種生物表達體系中都能得到良好表達。
基因合成的應用：一:克隆人鼠抗體或重組抗體；二:合成不同的基因突變株、SNPS、或其它突變株；三:設計合成DNA疫苗；四:大量合成用于微芯片的cDNA。
