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PC-ORD多元生態數據分析軟件
PC-ORD主要是關于生物邏輯的。它已經在生物周刊上發表了包括圖表和多重變量在內的5000多篇文章。
PC-ORD使生態數據的多元分析進入到電子表格中。我們強調的是非參數工具,圖形化的表述,并對群落數據分析的隨機測試。除了轉換數據和管理文件的工具外,PC-ORD 提供了許多在其他主要統計軟件包里面不包含的排序和分類技術,包括:CCA,DCA,MRPP,perMANOVA,雙向聚類,TWINSPAN, Beals 平滑,多樣性指數,物種清單,Mantel測試,統籌疊加方法(定量,符號編碼,彩色編碼,網格,聯合繪圖,雙標圖,連續矢量),各種旋轉方式,三維排序圖形,指標物種分析,Bray-Curtis排序,城市街區距離測量,物種區域曲線,樹木數據摘要,出版品質的聚類分析,自動導航模式的 NMS。還可以分析大型數據集。只要您的電腦里面有足夠的內存, 您就可處理矩陣數據達32,000 行或32,000 列, 矩陣元最高達536,848,900.
PC-ORD 功能亮點
圖表
• 三維排列
• 用于幻燈片或網頁的三維動態圖片
• 雙向聚類樹圖
• 有序的矩陣(按序列分數排序)
• 散布圖矩陣
• 簡易的散布圖分析
• 顯性多樣性曲線和頻繁的繪圖
• 頻率分布(分散的,連續的,密度估計)
• 叢神經覆蓋排列
圖形質量提高
• 把連續矢量還原(強光繪圖)
• 把矢量轉換為原始值并設單位長度
• PCA雙標圖矢量(為物種計算或以距離為基礎的雙標圖繪圖或其他變量)
• 把圖片保存為JPEG格式
• 把符號類型增加到最大化或單一圖片色彩從15調整到32位
• 設置圖片分辨率按百分比預覽以保存或粘帖
• 有定位內部,外部或交叉軸設置的選項
• 點的象限靈敏度標簽排列
• 聯合繪圖,雙標圖,連續矢量的操作箭頭和箭頭大小的選項
• 通過Gaussian kernel平滑對側面包絡散點圖的改善
分析
• 單向的,階乘的,嵌套和組塊的形式設計以排列為基礎的MANOVA (PerMANOVA)
• 雙向聚類分析
• 展示最重要的數據集的特征摘要
• 用密度估算技術計算平滑的單變量頻率分布
• 物種聯合以2*2列聯表
向導
• 在決策樹的基礎上幫助您決定如何分析您的數據
• 也可作為自學工具使用
數據管理和抽樣
• 輸入和輸出Excel文件
• 同時調整主要和次要的矩陣(如: 同時刪除兩個矩陣中的列)
• 通過主要和次要矩陣中的標準變量來過濾列
• 允許對第二個矩陣直接進行修改
• 允許命名更長的文件名
• 擴展矩陣(增加行和列的匹配)
已有分析的附加功能
• PCA隨機測試
• 直接對遠距離矩陣進行聚類分析
• 在等級相關或秩轉化的距離矩陣基礎上進行Mantel測試
• 把遠距離矩陣編寫成電子表格或者文本文件,全矩陣或成對列表
• 把NMS數據存為文本文件,電子表格或結果文件
• 由第二個矩陣中的一個變量來分解行和列的摘要。
軟件功能介紹
圖表
• 反射/旋轉排列
• 疊加的側面繪圖適合包絡分析
• 用于聚類分析的樹狀圖
• 物種面積曲線
• 物種面積曲線的置信帶
• NMS的陡坡圖
輸入/輸出
• 輸入/輸出Excel文件和Excel 2007文件
• 把分數輸出到電子表格中
• 把分數加到第二個矩陣中
• 輸入/輸出數據庫格式
PC-ORD特有的特征
• CCA
• NMS 自動導航模式 (NMDS)
• NMS預測模式 (NMDS)
• PerMANOVA
• 指示種分析 (Dufrêne & Legendre)
• DCA (DECORANA)
• TWINSPAN
• 雙向聚類分析 (biclustering)
• MRPP
• Blocked MRPP
• 物種面積曲線
• 多樣性標記
• 物種名單
• Mantel測試
• 多樣循環方式
• 三維排列圖表
• 出版質量的樹狀圖
• 排列覆蓋方式:帶符號和顏色編碼的定量, 網格, 聯合圖形, 雙標圖和連續矢量
• Bray-Curtis (Polar) 排列
• 街區距離測量
• 樹型數據摘要
• NMS, BC, PCA的物種排列
• Beals平滑
• 物種按群分組
• 修改成適合生態學的術語
總結
• 優秀的生態學教學助手
• 編輯矩陣電子表格