2016年 3月創騰科技生命科學分子模擬系列培訓安排
Discovery Studio2016輔助酶的理性設計
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培訓基本信息 Discovery Studio2016輔助酶的理性設計
培訓 時間：2016年3月28-30日，共三天
培訓地點： 【蘇州】創騰科技培訓中心
培訓 內容： 本次培訓以Discovery Studio2016軟件的基礎操作和應用為核心，以酶的理性設計為基礎，針對酶的理性設計中所涉及的技術進行介紹與上機操作，包括：基于酶的一級序列預測翻譯后修飾位點和酶的三維結構、酶-底物相互作用預測及優化、通過虛擬氨基酸突變設計同底物親和力更高的酶或穩定性更高的酶、預測并引入新的二硫鍵提高酶的穩定性、預測酶結構表面易聚集的位點并進行突變優化、采用常規動力學及拉伸動力學分析酶的構象變化等等。
· 培訓日程安排
| 日期 | 時間 | 內容 |
| 第一天 | 08:30-09:00 | 報到和注冊 |
| 報到地點： 蘇州創騰培訓中心 | ||
| 09:00-10:15 | Discovery Studio 基本界面 | |
| DS 背景介紹， DS 界面介紹，蛋白與小分子的預處理方法介紹與實際操作。 | ||
| 10:15-10:30 | 茶歇 | |
| 10:30-11:45 | 酶的理性設計概述 | |
| 酶的理性設計專題之一：酶的序列分析 | ||
| 基于酶的一級序列預測其翻譯后修飾位點，應用與操作。 | ||
| 酶的理性設計專題之二：酶結構的構建 | ||
| 同源建模核心原理介紹及案例分析，同源模板的選取技巧、同源模型的優化與評價等。 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-15:00 | 酶的理性設計專題之二：酶結構的構建 | |
| 同源建模參數設置意義、實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 15:00-15:15 | 茶歇 | |
| 15:15-16:30 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 (CDocker) | |
| 分子對接的核心與原理，酶催化位點的定義，酶 - 底物最終作用模式的選取與分析，關鍵氨基酸位點的識別與顯示方法， CDOCKER 基本原理及案例分析。 | ||
| 16:30-17:15 | 課程討論及答疑 | |
| 第二天 | 09:00-10:15 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 (CDocker) |
| CDOCKER 參數設置意義、實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 10:15-10:30 | 茶歇 | |
| 10:30-11:45 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 (FlexDock) | |
| 對接過程中蛋白分子柔性的考慮方法， Flexible Docking 基本原理介紹、案例分析； | ||
| 參數設置意義、 Flexible Docking 實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-15:00 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 ( 分子動力學模擬 ) | |
| MD 基本原理，溶劑模型的添加，束縛條件的設定，平衡狀態的判定等 ; | ||
| MD 參數設置意義、實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 15:00-15:15 | 茶歇 | |
| 15:15-16:45 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 ( 拉伸分子動力學模擬) | |
| SMD 基本原理與應用，外力的添加，力時間曲線的生成與分析， PMF 的計算與分析； | ||
| SMD 參數設置意義、實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 16:45-17:15 | 課程討論及答疑 | |
| 第三天 | 09:00-10:00 | 酶的理性設計專題之三：酶與底物相互作用機理研究 (QMMM) |
| QMMM 基本原理介紹、參數設置意義、實際操作技巧及結果分析 | ||
| 10:00-10:45 | 酶的理性設計專題之四：基于親和力進行酶設計 | |
| 突變位點、突變組合的建議，原理介紹、參數設置意義、實際操作技巧及結果分析 | ||
| 10:45-11:00 | 茶歇 | |
| 11:00-11:45 | 酶的理性設計專題之四：基于熱穩定性進行酶設計 | |
| 突變位點、突變組合的建議，原理介紹、參數設置意義、實際操作技巧及結果分析 | ||
| 11:45-13:30 | 午餐 | |
| 13:30-14:45 | 酶的理性設計專題之四：蛋白二硫鍵的預測與引入 | |
| 二硫鍵位點的選取方法，實際操作技巧及結果分析。 | ||
| 酶的理性設計專題之四：基于蛋白聚集效應進行酶設計 | ||
| 建議可能的突變位點降低酶的聚集，基本原理介紹、參數設置意義、實際操作技巧及結果分析 | ||
| 14:45-15:00 | 茶歇 | |
| 15:00-16:00 | 酶的理性設計專題之五：篩選酶的潛在底物 | |
| 篩選命中率提高的方法， Libdock 和 LigandFit 基本原理介紹、參數設置意義、實際操作技巧及結果分析 | ||
| 16:00-17:00 | 課程討論及答疑 |
· 培訓費用
| 注冊類型 |
培訓費用 (1 人參加) |
優惠 價格及條件（符合任一條件即可） 優惠條件（不可與其他優惠條件同享）： 1 、3月21日前成功報名并匯款； 2、 同一單位，≥2人參加； 2 、 同一學員（2011年至今）曾參加過DS培訓課程 |
| 教育科研客戶 | 3600/ 人 | 3000/ 人 |
| 政府科研/企業客戶 | 5400/ 人 | 4500/ 人 |
· 報名方式
報名請登入創騰科技網站：www.neotrident.com，歡迎感興趣的老師和同學踴躍報名。名額有限，報名從速!
· 關于蘇州創騰科技培訓中心
2016新培訓基地——蘇州培訓中心正式運營!
新的培訓中心坐落在蘇州工業園區2.5產業園內，這里地處蘇州工業園區中新大道與中環路東側，具有英倫古典學院風的建筑群，提供包括銀行、郵政、中西餐廳、精品書屋、商業 零售、運動休閑等生活配套載體;目前已經吸引包括IBM、百特醫療、TE在內的多家世界名企落戶。
創騰科技(蘇州)培訓中心配備了國際最先進的研發信息化軟硬件資源，相信嶄新的學習環境、領先的軟硬件設施、以及濃郁的學習氛圍能給學員帶來愉快地學習體驗。創騰科技的培訓講師都具有多年相關領域研發與實戰經驗，從理論到實踐，從初級到高級，從入門到精通，通過實例講解和上機操作結合的授課模式，來快速提升學員對信息化科研工具的理解和掌握。創騰科技將力求為學員提供最專業，最完善的培訓服務!
希望蘇州培訓基地的成立能為國內相關的研發機構輸出一大批優秀的人才，加速我國研發信息化的步伐。
>>報名請登入創騰科技網站：www.neotrident.com
