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DNA Sequence Assembler是一款易于使用的生物信息學軟件，用于自動DNA序列組裝、DNA序列分析、重疊群編輯、文件格式轉換和突變檢測。
DNA Sequence Assembler是可以自動化組裝過程的工具：
自動檢測和修剪樣品的低質量區域
自動修剪載體/引物序列
自動糾正重疊群中的歧義
自動將contig保存到磁盤
使用DNA Sequence Assembler，您只需5秒即可從未組裝的樣本（具有不可信末端和向量的“dirty"樣品）到結尾輸出數據（重疊群、清理并保存到磁盤）。
使用DNA Sequence Assembler，您還可以：
將多個DNA樣本組裝或比對到參考序列
按名稱批量組裝或對齊序列組（它將自動識別序列對）
瀏覽文件夾時預覽FASTA序列和色譜圖
查看、分析和編輯ABI、SCF、FASTA、SEQ、TXT、GBK序列
用顏色標記特定的色譜圖區域（如差異、低質量區域）并快速導航到這些區域
在不同的文件格式（ABI、SCF、SEQ、FASTA、multi-FASTA、GBK...)之間進行轉換或批量轉換
檢測雙峰突變
檢測兩個（或多個）色譜圖之間的突變
使用嵌入式堿基調用程度重新調用未確定(N)堿基
重新評估基礎質量(QV)
使用同步的色譜圖/組裝網格/重疊群圖輕松概覽您的項目
DNA Baser Sequence Assembler的主要的特點是它自動化了DNA序列組織過程。只需將程序指向您的樣本所在的文件夾，程序就會為您完成全部步驟。
一些核心功能是：
色譜圖壞端的自動清理
自動識別序列（載體、引物）清理
自動更正contig中的模糊堿基。您將永遠不必編輯您的重疊群
自動將contig、日志和項目數據保存到磁盤
自動引物檢測和載體去除
自動批量組裝?？梢砸淮谓M裝數千個重疊群
組裝參考
色譜圖和重疊群之間的同步顯示，這使得迷糊堿基的校正更快更方便
歧義/不匹配之間的快速導航。只需單擊一下即可跳轉到下一個不匹配項
集成堿基檢出器
色譜圖查看器和編輯器（ABI和SCF）
項目圖
準確度
將項目（輸入序列、重疊群、用戶編輯等）保存到磁盤以供以后檢查/編輯。您可以稍后將其他樣本添加到您的conting
記住用戶所做的基本編輯
嵌入式生物學工具
批量序列處理（批量結束修剪、向量去除、元數據集成、FASTA轉換...）
批量元數據集成工具（只限RNA Baser）
克隆庫取消復制器
全部轉換為multi-FASTA轉換器
全部轉換為FASTA轉換器
GenBank到FASTA轉換器
反向補充
一鍵轉換多種文件格式
【英文介紹】
DNA Sequence Assembler is revolutionary bioinformatics software for automayic DNA sequence assembly, DNA sequence analysis, contig editing, file format conversion and mutation detection.
DNA Sequence Assembler is the only tool that fully automated the assembly process:
Automatically detect and trim low quality regions of your samples
Automatically trim vector/primer sequences
Automatically correct the ambiguities in your contig
Automatically save the contig to disk
With DNA Sequence Assembler you need ONLY 5 (five) seconds to go from unassembled samples ("dirty" samples with untrusted ends and vectors) to the final output data (the contig, cleaned and saved to disk).
With DNA Sequence Assembler you can also:
Assemble or align multiple DNA samples to a reference sequenceBatch assemble or align groups of sequences by name (it will automatically recognize sequence pairs)
Preview FASTA sequences and chromatograms as you navigate through your folders
View, analyze and edit ABI, SCF, FASTA, SEQ, TXT, GBK sequences
Mark specific chromatogram regions (like discrepancies, low-quality areas) with colors & quickly navigate to these regions
Convert or batch-convert between different file formats (ABI, SCF, SEQ, FASTA, multi-FASTA, GBK...)
Detect double peak mutations
Detect mutations between two (or more) chromatograms
Use the embedded base caller to re-call undetermined (N) bases
Reassess the base quality (QV)
Easily overview your project using the synchronized chromatogram/assembly grid/contig map
