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Lynnon Biosoft 為激動人心的基因組科學的教育、研究和開發開發和銷售生物信息學軟件平臺。我們的產品 DNAMAN 軟件包為序列分析和數據挖掘提供了一個有效的工具包。
什么是DNAMAN
DNAMAN適用于分析生物學應用的一體化軟件包。改軟件包為序列分析提供了一個就有多種功能的集成系統。您不再需要一個程序進行限制性分析，而其他程序進行多序列對比、設計PCR引物、蛋白質序列分析或繪制質粒.....DNAMAN為您執行這些任務。
DNAMAN的速度、多功能性、準確性和高質量的演示使其成為每個分子生物學家可以依賴的基本工具之一。DNAMAN是眾多評審科學期刊中高度引用的序列分析軟件。他也是一個序列分析軟件包，每所大學、研究機構、實驗室和研究科學家都可以負擔的起。
DANMAN可用于Microsoft Windows、OSX和Linux。三個平臺上的DANMAN文件共享相同的格式。
DANMAN的通用格式系統方便了Windows、Mac OSX和Linux之間的通信，使您的平臺獨立。
DNAMAN 序列分析功能簡介
序列分析集成系統
Windows、OSX 和 Linux 上的 DNAMAN 桌面
適用于 Windows 的 DNAMAN
用于 OSX 的 DNAMAN
用于 Linux 的 DNAMAN
序列操作
序列處理和轉換
序列輸入
DNAMAN 序列是用關鍵字格式化的純文本文件。該程序接受其他常見的序列格式，例如 GenBank、GCG、CUSTAL、FASTA、PIR 和 GDE。DNAMAN 利用序列通道將活動序列保存在內存中以進行快速計算。數據庫也可用于幫助組織特定研究項目的序列。三個序列輸入界面均可在 DNAMAN Desktop 上訪問。
序列組成和轉換
DNAMAN 使用簡單的下拉菜單命令報告序列組成和分子量。它可以將序列轉換為其反向、互補、反向互補、雙鏈和 RNA 序列。
序列搜索
列搜索
DNAMAN 提供用于序列搜索和比較的工具，包括核苷酸或氨基酸序列、共有序列、開放閱讀框、重復序列。小干擾 RNA (siRNA) 選擇工具可用于提高 siRNA 設計的質量。用戶可以在 DNAMAN 程序中對 NCBI 數據庫或其他基于網絡的序列服務器執行 BLAST 搜索。
限制分析
DNAMAN 為 DNA 序列的限制性分析提供直觀的界面。結果可以顯示為文本、限制圖和限制模式（瓊脂糖凝膠）。其他工具包括電子克隆、從片段重建限制性圖譜、靜默突變和定向錯配。
序列組裝
DNAMAN 使用快速準確的比對算法來組裝大量序列。跟蹤文件可以直接用于匯編。SNP可以通過組裝的序列集進行驗證。
同源比較
點陣圖
可以使用點圖在 DNAMAN 中分析大序列的同源區域。感興趣的序列區域可以放大并直接對齊。
兩個序列比對
DNAMAN 提供了快速或優化的算法來比對兩個 DNA 或蛋白質序列。
多序列比對
DNAMAN 使用 ClustalW 算法（Feng-Doolittle 和 Thompson）進行對齊，使用全局對齊算法（Wilbur 和 Lipman）進行快速對齊。DNAMAN 中的三種比對提供了高質量的比對結果。使用快速比對方法，您可以快速比對大量 DNA 或蛋白質序列?？梢栽诙啾葘π蛄芯庉嬈髦羞M一步修改或調整比對。
系統發育分析
DNAMAN 使用通用算法計算同源矩陣并建立全部序列對之間的相關距離。它可以生成距離矩陣，并從多個比對中繪制系統發育樹或同源樹。自舉分析可用于系統發育樹的置信度值。
引物/寡核苷酸分析
PCR引物設計
DNAMAN 為 PCR 引物選擇提供了控制標準。您可以通過設置目標 DNA 的區域、PCR 產物的大小、引物特性、反應條件和引物配置來優化引物過濾。
其他功能
可以分析寡核苷酸引物的解鏈溫度、互補性、錯誤引物、沉默突變和定向錯配。
蛋白質分析
蛋白質序列分析
DNAMAN 提供了用于蛋白質序列分析的工具，包括：從兩個 DNA 鏈中翻譯六個閱讀框、遺傳密碼表的變異、閱讀框概述、密碼子使用分析、氨基酸組成、親水譜、電荷和 pI 分析、二級結構預測和反向翻譯。
數據庫管理
DNAMAN 數據庫管理
DNAMAN 使用標準關系數據庫引擎 Sqlite3 來管理 DNA/蛋白質序列和寡核苷酸序列。
LBDraw（限 Windows）
LBDdraw的特點
在 Internet 上（限 Windows）
適用于 Windows 的內置 DNAMAN Internet/Intranet 瀏覽器
DNAMAN 提供了一個集成的 Web 瀏覽器來訪問 Internet 或您的 Intranet。
