首先在定氮儀蒸氣發生器中加約2/3體積蒸餾水，加入數滴硫酸使其保持酸性，以避免水中的氨被蒸出而影響結果，并放入少許沸石(或毛細管等)，以防爆沸。這個步驟有點類似于凱氏定氮法的消化前步驟，用相應的試劑對其進行清洗。沿小玻杯壁加入蒸餾水約20mL讓水經插管流入反應室，但玻杯內的水不要放光，塞上棒狀玻塞，保持水封，防止漏氣。這一步可直接驗證插管是否可以使用。
蒸氣發生后，立即關閉廢液排放管上的開關，使蒸氣只能進入反應室，導致反應室內的水迅速沸騰，蒸出蒸氣由反應室上端口通過定氮球進入冷凝管冷卻，在冷凝管下端放置一個錐形瓶接收冷凝水。從定氮球發燙開始計時，連續蒸煮5min，然后移開煤氣燈。沖洗完畢，夾緊蒸氣發生器與收集器之間的連接橡膠管，由于氣體冷卻壓力降低，反應室內廢液自動抽到反應室外殼中，打開廢液排出口夾子放出廢液。整個清洗過程，到這里就結束了，經過清洗這個過程，定氮儀內部環境已經符合我們測定蛋白質含量的需求，另外，定氮儀的各部件也得到了檢驗，可以及時更換漏氣或者其他壞了的部分。根據以上步驟重復清洗2～3次，再在冷凝管下換放一個盛有硼酸-指示劑混合液的錐形瓶使冷凝管下口完全浸沒在溶液中，蒸餾1～2min，觀察錐形瓶內的溶液是否變色。如不變色，表示蒸餾裝置內部已洗干凈。
定氮儀蒸主要特征：
1.定氮蒸餾器工作用水采用自來水和蒸餾水均可。
2.儀器采用一鍵式操作，只要按下工作鍵，儀器將按照設定的量自動進行加水、加堿和蒸餾。
3.樣品蒸餾完成后有聲音報警。
4.定氮蒸餾器采用了高性能進口堿泵，大大延長了堿泵的使用壽命。
5.設置了專門的清洗鍵，可對堿回路進行清洗，避免堿結晶的產生。
